Index

F

fromdict() (strainjedi.jedi.Jedi class method)

G

Gaussian (class in strainjedi.io.gaussian) GaussianOptimizer (class in strainjedi.io.gaussian) get_b_matrix() (strainjedi.jedi.Jedi method) get_common_rims() (strainjedi.jedi.Jedi method) get_delta_q() (strainjedi.jedi.Jedi method)

get_energies() (strainjedi.jedi.Jedi method) get_hbonds() (in module strainjedi.jedi) get_hessian() (strainjedi.jedi.Jedi method) get_rims() (strainjedi.jedi.Jedi method) get_vibrations() (in module strainjedi.io.gaussian) (in module strainjedi.io.qchem)

J

Jedi (class in strainjedi.jedi) jedi_analysis() (in module strainjedi.jedi)

jedi_printout() (in module strainjedi.jedi) jedi_printout_bonds() (in module strainjedi.jedi)

P

partial_analysis() (strainjedi.jedi.Jedi method)

post_process() (strainjedi.jedi.Jedi method)

Q

QChem (class in strainjedi.io.qchem)

QChemOptimizer (class in strainjedi.io.qchem)

R

read() (in module strainjedi.io.qchem) (strainjedi.jedi.Jedi class method)

read_gaussian_out() (in module strainjedi.io.gaussian) read_results() (strainjedi.io.gaussian.Gaussian method) run() (strainjedi.jedi.Jedi method)

S

set_bond_params() (strainjedi.jedi.Jedi method)

T

todict() (strainjedi.jedi.Jedi method)

V

vmd_gen() (strainjedi.jedi.Jedi method)

W

write() (strainjedi.jedi.Jedi method)

write_input() (strainjedi.io.gaussian.Gaussian method) (strainjedi.io.qchem.QChem method)